Pada salah satu bukunya, Husein Ja'far Al Hadar mendeskripsikan YAPI sebagai pesantren "yang menjadikan Syiah sebagai salah satu mazhab Islam yang diajarkan dan dikaji secara terbuka bersama mazhab-mazhab lain, khususnya Suni".
Baca Juga: Apa Kata Bang Didi Tentang Pertandingan South Pert Australia 2 Vs. 4 Timnas Futsal Putri Indonesia
Pada 2011, Ketua YAPI Mukhsin Assegaf menyatakan bahwa YAPI merupakan pesantren "non-sektarian" dan "mengajarkan semua paham".
Walaupun demikian, walaupun tudingan-tudingan yang ditujukan kepadanya semakin gencar dan menyudutkan, tetapi sampai saat artikel ini dibuat Habib Milenial tersebut belum terlihat memberikan tanggapannya.
Silakan bagikan artikel ini dan selalu jaga kesehatan.